遥远太空中移动的行星震颤了无数文明的心神，他们使尽浑身解数希望摸到这个文明的底细，但沉寂的星球表面探测不到任何生命的痕迹，只有行星屁股上微弱的白光昭示着这是一颗存在过文明的星球。一些文明因此被吓的战战兢兢，任何太空探测都如履薄冰。

不过一个银河系便如此纷繁复杂，整个宇宙中那么多星团，不知道更有文明几何，更不知道人家已发展到了何种程度，结合已经捕捉偷听到的信息，某些文明悟了，整个宇宙就是一个巨大的黑暗森林，弱肉强食。大家开始掩盖自己的行踪，放低自己的声音，默默疯狂的发展自己的战力，如果做不到永远逃避那就先下手为强。

一些原本与邻近星系文明互相交流的，甚至开始开启行星系间航行的文明也开始低调起来。只有少数生性纯良的物种还在不遗余力的向宇宙中探索，并发出自己的声音。

文明的发展速度在某个阶段往往是呈几何倍数增长的。又是数万年过去，有许多文明发展出了载人亚光速航行技术，各种武器更是花样百出，超光速通讯技术、短距离空间传送日趋成熟。在过去的几万年里，银河系中不少文明又观测到距自己数数百万光年外一个恒星系的湮灭，前一秒还静静闪耀的地方，突然爆闪然后消失。之后数百年再未探测到这个恒星系。

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这个样的景象彻底刺破了一些文明的防线。那些认为宇宙中存在黑暗森林法则的文明中发展靠前的，决定先下手为强，开始挑起星际战争，掠夺资源，以求尽早找到更强的科技手段，以免成为黑暗森林中的猎物，他们以AI为先驱，在相邻星系间建立空间传送阵，将大量眼线粒子散播到到星河各处，向可能存在文明的行星系散步生物病毒。

操控粒子封锁弱小文明的科技，掠夺资源，进行星际殖民，挑起星际战争。使用下三滥的手段，派出敢死队幽灵船伪装成星际流民，向高等级文明投毒，夺取别人的先进科技。星际战争在一群被吓破胆的族群间点燃，像病毒一般在混乱中快速蔓延。为了夺取胜利，一些文明开始不择手段。有文明培育出了一种可在真空状态下存活的病毒，可感染所有的有机生命体，一旦被感染要么沦为行尸走肉，要么数小时内暴毙而亡，因为一旦生物感染，数小时全身便会长出大量充满病毒的水泡，水泡会爆裂向四周喷射出大量病毒，他们将这样的瘟疫病毒称为死亡孢子。

他们将装有孢子的无人飞船通过传送门送到银河系中已有且能到达的星系文明，又向太空中发射了大量漫游孢子炸弹，企图将孢子传到整个星系团，这样他们便能在不引起狩猎者发现的情况下消灭异己。仗着自己的拥有防护疫苗免疫，他们为所欲为。不过短短数年便制造了数个星系生物大灭绝。我

一些星球依靠其他星球极个别幸存者制造了疫苗，却埋下了更大的隐患。很快最开始制造孢子的文明发现他们看起来免疫不受侵蚀，一旦接触孢子将成为更恐怖的传染源，他们制造的感染甚至比原始毒株更恐怖，凡是他们接触的未接受疫苗的生命感染死亡更快。并且慢慢地他们便发现，所有接触疫苗的人，全部都丧失了生殖能力，即便在动植物和真菌上也是如此。

有勇敢的文明站出来向周边星域广播喊话，希望大家能团结起来，不要被恐惧所支配，不要自取灭亡，却被认为是害群之马，认为他们不过是想暴露大家在黑暗森林的位置，被群起而攻之。不得已之下，不认同黑暗森林法则的天真派文明也加入战斗，并结成同盟，誓要阻止这场瘟疫，他们利用重力炸弹，高能核聚变炸弹，炸毁被感染的星球。然而这并未能阻止死亡孢子的扩散，反而使孢子在星球间扩散更快。那些扩散进太空中的孢子随意飘散，成为巨大的隐患。